THE IMPORTANCE OF ANTIMICROBIAL COMPOUNDS PRODUCED BY BENEFICIAL BACTERIA ON THE BIOCONTROL OF PHYTOPATHOGENS Translated title: Importancia de compuestos antimicrobianos producidos por bacterias benéficas en el biocontrol de fitopatógenos

Abstract

ABSTRACT Bacteria produce antimicrobial compounds to compete for nutrients and space in a particular habitat. Antagonistic interactions can be evaluated by several methodologies including the double-layer agar and simultaneous inhibition assays. Among the well-known inhibitory substances produced by bacteria are the broad-spectrum antibiotics, organic acids, siderophores, antifungal, and bacteriocins. The most studied bacterial genera able to produce these inhibitory substances are Enterococcus, Lactococcus, Streptomyces, Bacillus, Pseudomonas, Klebsiella, Escherichia, and Burkholderia. Some beneficial bacteria can promote plant growth and degrade toxic compounds in the environment representing an attractive solution to diverse issues in agriculture and soil pollution, particularly in fields with damaged soils where pesticides and fertilizers have been indiscriminately used. Beneficial bacteria may increase plant health by inhibiting pathogenic microorganisms; some examples include Gluconacetobacter diazotrophicus, Azospirullum brasilense, Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas protegens, and Burkholderia tropica. However, most studies showing the antagonistic potential of these bacteria have been performed in vitro, and just a few of them have been evaluated in association with plants. Several inhibitory substances involved in pathogen antagonism have not been elucidated yet; in fact, we know only 1 % of the bacterial diversity in a natural environment leading us to assume that many other inhibitory substances remain unexplored. In this review, we will describe the characteristics of some antimicrobial compounds produced by beneficial bacteria, the principal methodologies performed to evaluate their production, modes of action, and their importance for biotechnological purposes.

Translated abstract

RESUMEN Las bacterias producen compuestos antimicrobianos para competir por nutrientes y espacio en un hábitat particular. Las interacciones antagónicas pueden evaluarse mediante varias metodologías, incluido el agar de doble capa y los ensayos de inhibición simultánea. Las sustancias inhibidoras mejor conocidas producidas por bacterias incluyen antibióticos, ácidos orgánicos, sideróforos, antifúngicos y bacteriocinas. Entre los géneros bacterianos más estudiados que producen sustancias inhibidoras se incluyen Enterococcus, Lactococcus, Streptomyces, Bacillus, Pseudomonas, Klebsiella, Escherichia y Burkholderia. Algunas bacterias beneficiosas tienen la capacidad de promover el crecimiento de las plantas y degradar compuestos tóxicos en el ambiente, por lo que podrían incrementar el rendimiento de los cultivos y disminuir problemas de contaminación del suelo, especialmente donde los pesticidas y fertilizantes han sido utilizados indiscriminadamente. Algunas bacterias beneficiosas pueden aumentar la salud de las plantas al inhibir microorganismos patógenos, por ejemplo, Gluconacetobacter diazotrophicus, Azospirullum brasilense, Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas protegens y Burkholderia tropica. Sin embargo, la mayoría de los estudios que muestran el potencial antagónico de estas bacterias se han realizado in vitro, y pocos de ellos se han evaluado en asociación con plantas. Varias sustancias inhibitorias implicadas en el antagonismo de los patógenos aún son desconocidas; de hecho, sabemos que solo se ha aislado el 1 % de la diversidad bacteriana en un ambiente natural, lo que sugiere que hay muchas otras sustancias inhibitorias que no han sido exploradas. En esta revisión describimos las características de algunos compuestos antimicrobianos producidos por bacterias beneficiosas, las principales metodologías usadas para evaluar su producción, modos de acción y su importancia para fines biotecnológicos.